厦门大学高等教育发展研究中心(与厦门大学高等教育科学研究所同源，为名称平行及网站合二为一的机构；厦门大学高等教育科学研究所还下设民办高教研究中心, 另设厦门大学考试研究中心和厦门大学网络教育研究中心)，创于1978年5月27日，原称高等教育科学研究室，1984年2月经教育部批准改所并下达编制指标，是中国最早成立的以高等教育为研究对象的专门机构；经国务院学位委员会1984年1月13日批准为高等教育硕士学位授予点，1986年7月28日批准为高等教育学博士学位授予点、潘懋元教授为博士生导师。这是中国第一个有权授予高等教育学硕士和博士学位的单位和第一位高等教育学博士生导师。1988年7月22日，经国家教委批准为全国高等教育学重点学科点。1996年，以厦门大学高教所为依托的高等教育学科被批准为国家“211工程”重点建设项目，又于2002年再次连续成为国家"211工程"重点建设项目。2000年1月以厦门大学高教所为依托，重组成立了高等教育发展研究中心，并于2000年9月5日成为教育部人文社科重点科研基地之一。继1988年第一次入选后，厦门大学高教所高等教育学学科于2002年再次连续入选为全国高等学校重点学科，2003年10月，经国家人事部和全国博士后管委会批准，厦门大学高教发展研究中心设立教育学博士后科研流动站。
本中心的主要任务是研究中国和世界高等教育的理论与发展动态，研究中国高等教育管理问题，研究青年心理，建立与发展高等教育学科和青年心理学科；培养高等教育、高等教育管理、青年心理的理论工作者和实际工作者；积极促进教育学、心理学领域的国内外学术交流，积极推动和组织全国高等教育研究活动，为中国和世界的高等教育发展和学科建设作出贡献。